V pobrežných oblastiach vládne tropická klíma, ochladzovaná monzúnovým vetrom. V nížinách je horúco a väčšinou sucho, vo vyšších polohách je počasie miernejšie so štyrmi ročnými obdobiami.
Nairobi má vďaka svojej nadmorskej výške príjemnú klímu počas celého roka.
Pri jazere Victoria sú teploty oveľa vyššie a vyskytujú sa tu silné búrky.