Bazilej sa pýši mnohými historickými budovami, monumentmi, múzeami či galériami. V nasledujúcom prehľade spomeňme aspoň tie najznámejšie.
Mestská radnica (Rathaus) postavená v burgundskom štýle v roku 1504 dominuje centrálnemu námestiu Marktplatz. Fasáda pieskovcovej budovy je dekorovaná bohatými freskami.
Na južnej strane námestia Petersplatz sa nachádza jedna z najstarších vzdelanostných inštitúcií vo Švajčiarsku – Bazilejská Univerzita, otvorená v roku 1460 zakladateľskou listinou, ktorú podpísal pápež Pius II. V tunajšej knižnici sú uložené vzácne rukopisy, vrátane prác Martina Luthera, Erasmusa a Zwingliho.
Západne od univerzity sa rozkladá stredoveká mestská brána – Spalentor (1400), ktorá prešla mohutnou rekonštrukciou v priebehu 19. storočia. Spalentor sa so svojou špicatou strechou a cimburiami radí k jedným z najkrajších a najzachovalejších mestských opevnení vo Švajčiarsku.
Historické múzeum v Bazileji je jednou z najväčších a najdôležitejších inštitúcií svojho druhu vo Švajčiarsku. Hlavná expozícia múzea sa nachádza v chráme Barfüsserkirche. Múzeum, ktorého história siaha do 19. storočia, sa postupne rozrástlo do rozlohy 6200 metrov štvorcových. Má ešte tri ďalšie časti, z ktorých dve ležia v blízkosti mestského centra.
Farmaceuticko-historické múzeum sa pýši bohatou zbierkou starých medicínskych produktov, laboratórnych pomôcok a keramiky a pôvodných, lekárnických kníh.
Múzeum švajčiarskeho maliara a sochára Jeana Tinguleyho patrí k najnavštevovanejším atrakciám mesta.
K iným populárnym múzeám umenia v resp. galériám sa radia napr. Kunstmuseum, Vitra Design Museum, Fondation Beyeler či Kunsthalle.